Phylogénie des souches d’E. coli résistantes aux fluoroquinolones isolées au niveau de la station d’épuration de Boumerdes.
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Date
2013-10-23
Authors
BELKAID Hamza
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Abstract
Durant le processus du traitement des eaux usées, des changements qualitatifs et quantitatifs dans la distribution des populations bactériennes sont observés.
Ces modifications ont pour conséquence la réduction de la charge microbienne dont la population résistante et pathogène. Cependant, plusieurs études ont rapporté la présence de bactéries résistantes dans les eaux usées traitées (Guardabassi et al., 2002). La station d'épuration des eaux usées est un intermédiaire entre les activités humaines et l'environnement, et est un compartiment favorable pour le maintien et la dissémination de la résistance par la pression de sélection exercée par les différentes molécules (antibiotiques, métaux lourds, désinfectants...etc) ainsi que les échanges génétiques favorisés à l'intérieur des biofilms (10 à 600 fois plus de transfert). Ces derniers deviendraient propices à l'émergence de nouveaux pathogènes par l'acquisition des gènes de résistances, de facteurs de virulence et de capacités à la survie environnementale (Watnick et Kolter ; 2000).
Les systèmes d'épuration des eaux usées rejettent à des concentrations variables des bactéries d'origine entérique dans l'environnement. Le devenir de ces rejets dans le milieu récepteur peut revêtir une importance sanitaire dans le cas du milieu littoral, puisque les activités de baignade, et surtout de conchyliculture sont menacées par une contamination bactérienne d'origine fécale (Dupray et Derrien, 1994).
Ce travail s'inscrit dans le cadre de projet de recherche sur l'évaluation de la virulence et résistance aux antibiotiques des souches à Gram négatif isolées à partir des milieux aquatiques. Il complète une étude entamée en 2010. Dans ce travail, nous nous sommes intéressés à la détermination des groupes phylogénétiques des souches d'E.coli isolées à partir des eaux usées et eaux traitées au niveau de la station d'épuration des eaux usées urbaines de Boumerdes.
Pour réaliser ce travail nous avons adopté le plan suivant :
Confirmation de la résistance aux fluoroquinolones.
Identification des bactéries résistantes.
Détermination des groupes phylogénétiques par PCR.
Evaluation de la résistance des souches aux antibiotiques par antibiogramme.